“每個(gè)人的家譜”：研究人員構(gòu)建了迄今為止最大的人類系譜
（神秘的地球uux.cn報(bào)道）據(jù)EurekAlert!：一項(xiàng)新的研究披露，通過結(jié)合眾多數(shù)據(jù)集中的家譜數(shù)千個(gè)現(xiàn)代人和古人基因組，研究人員構(gòu)建了迄今為止最大的研究福州外圍（高端外圍）外圍模特（電話微信181-8279-1445）一二線城市外圍預(yù)約外圍上門外圍女，不收任何定金30分鐘內(nèi)快速到達(dá)人類系譜。這一新的構(gòu)建“每個(gè)人的家譜”為人類歷史上關(guān)鍵事件及其發(fā)生時(shí)間和地理位置提供了線索?，F(xiàn)代人和古人基因組都是迄今極有用的工具，它們極大地提高了我們對(duì)人類演化及人類在地球上漫長歷史的為止了解。
迄今為止，類系已收集了數(shù)千個(gè)人類基因組。人的人然而，家譜獲取這些數(shù)據(jù)所用的研究不同方法、它們變化無常的構(gòu)建福州外圍（高端外圍）外圍模特（電話微信181-8279-1445）一二線城市外圍預(yù)約外圍上門外圍女，不收任何定金30分鐘內(nèi)快速到達(dá)品質(zhì)以及所用分析中固有的局限性（尤其是碎片化的古DNA）使得在五花八門的基因組之間進(jìn)行比較變得困難。更重要的迄今是，每個(gè)人類基因組都包含來自不同時(shí)代多個(gè)不同世系的為止基因片段。因此，類系繪制一幅完整的人的人人類歷史譜系和基因組變異圖是相當(dāng)大的技術(shù)挑戰(zhàn)，因而仍未得到解決。
Anthony Wohns和同事通過對(duì)古人和現(xiàn)代人基因組應(yīng)用非參數(shù)決策樹記錄法（non-parametric tree-recording method）來解決這一問題，該方法使作者能夠推斷出全面的現(xiàn)代人和古人譜系。該方法利用的是采自超過215個(gè)不同人群的3500多個(gè)現(xiàn)代人及高品質(zhì)古人基因組和另外3000個(gè)品質(zhì)較差的古人基因組；這一方法允許存在數(shù)據(jù)缺失和錯(cuò)誤，并能用碎片化的古人基因組幫助確定等位基因出現(xiàn)的時(shí)間。由此，Wohns等人研發(fā)了一個(gè)人類一體化譜系，它記錄了人類歷史中關(guān)鍵性的群體事件，包括那些得到良好表征的事件，如人類從非洲向外遷徙的事件。
Jasmin Rees和Aida Andrés在相關(guān)的《視角》中寫道：“樹-記錄法（tree-recording methods）的能力和分辨率有望幫助澄清人類和其它物種的演化史。推斷未來演化史的最強(qiáng)有力的方法有可能牢固地植根于這些方法之中?！?br>相關(guān)鏈接：https://www.science.org/doi/10.1126/science.abi8264
相關(guān)報(bào)道：牛津大學(xué)研究人員創(chuàng)建有史以來最大的人類家譜
（神秘的地球uux.cn報(bào)道）據(jù)cnBeta：來自牛津大學(xué)大數(shù)據(jù)研究所的研究人員在繪制人類的全部遺傳關(guān)系圖方面邁出了重要的一步：一個(gè)可以追溯我們所有人的祖先的單一家譜。這項(xiàng)研究周四已經(jīng)發(fā)表在《科學(xué)》雜志上。
人類遺傳多樣性的新譜系網(wǎng)絡(luò)以前所未有的細(xì)節(jié)揭示了世界各地的個(gè)體之間的關(guān)系。該研究預(yù)測了共同的祖先，包括他們生活的大概時(shí)間和地點(diǎn)。
該分析恢復(fù)了人類進(jìn)化史上的關(guān)鍵事件，包括從非洲遷移出來的事件。該基本方法可在醫(yī)學(xué)研究中得到廣泛的應(yīng)用，例如確定疾病風(fēng)險(xiǎn)的遺傳預(yù)測因素。
過去二十年來，人類基因研究取得了非凡的進(jìn)展，產(chǎn)生了數(shù)十萬人的基因組數(shù)據(jù)，包括來自成千上萬的史前人類。這帶來了一種令人興奮的可能性，即追蹤人類遺傳多樣性的起源，以產(chǎn)生一個(gè)完整的關(guān)于世界各地的個(gè)人如何相互關(guān)聯(lián)的地圖。
到目前為止，這一愿景的主要挑戰(zhàn)是找出一種方法來結(jié)合來自許多不同數(shù)據(jù)庫的基因組序列，并開發(fā)出處理這種規(guī)模數(shù)據(jù)的算法。然而，牛津大學(xué)大數(shù)據(jù)研究所的研究人員周四發(fā)表的一種新方法可以很容易地結(jié)合來自多個(gè)來源的數(shù)據(jù)，并可擴(kuò)展到容納數(shù)百萬的基因組序列。
大數(shù)據(jù)研究所的進(jìn)化遺傳學(xué)家，主要作者之一黃燕（音譯）博士解釋說：“我們基本上建立了一個(gè)巨大的家譜，一個(gè)全人類的家譜，盡可能準(zhǔn)確地模擬產(chǎn)生我們今天在人類中發(fā)現(xiàn)的所有遺傳變異的歷史。這個(gè)家譜使我們能夠看到每個(gè)人的基因序列與其他每個(gè)人的關(guān)系，沿著基因組的所有點(diǎn)。”
由于單個(gè)基因組區(qū)域只從父母一方，即母親或父親那里繼承，基因組上每個(gè)點(diǎn)的祖先可以被認(rèn)為是“一棵樹”。這組“樹”被稱為 “樹序列”或“祖先重組圖”，它將基因區(qū)域通過時(shí)間追溯到遺傳變異首次出現(xiàn)的祖先。
主要作者Anthony Wilder Wohns博士，作為他在大數(shù)據(jù)研究所的博士學(xué)位的一部分進(jìn)行了這項(xiàng)研究，現(xiàn)在是麻省理工學(xué)院和哈佛大學(xué)的Broad研究所的博士后研究員。他說：“從本質(zhì)上講，我們正在重建我們祖先的基因組，并利用它們形成一個(gè)龐大的關(guān)系網(wǎng)絡(luò)。然后我們可以估計(jì)這些祖先生活的時(shí)間和地點(diǎn)。我們的方法的力量在于，它對(duì)基礎(chǔ)數(shù)據(jù)的假設(shè)很少，而且還可以包括現(xiàn)代和古代的DNA樣本?！?br>該研究整合了來自八個(gè)不同數(shù)據(jù)庫的現(xiàn)代和古代人類基因組數(shù)據(jù)，并包括了來自215個(gè)人口的總共3609個(gè)個(gè)體基因組序列。古代基因組包括在世界各地發(fā)現(xiàn)的樣本，年齡從1000年到超過10萬年不等。該算法預(yù)測了進(jìn)化樹中必須存在的共同祖先的位置，以解釋遺傳變異的模式。結(jié)果網(wǎng)絡(luò)包含了近2700萬個(gè)祖先。
在添加了這些樣本基因組的位置數(shù)據(jù)后，作者使用該網(wǎng)絡(luò)來估計(jì)預(yù)測的共同祖先的居住地。結(jié)果成功地重現(xiàn)了人類進(jìn)化史上的關(guān)鍵事件，包括從非洲遷移出來。
盡管譜系圖已經(jīng)是一個(gè)極其豐富的資源，但研究小組計(jì)劃通過繼續(xù)納入可用的遺傳數(shù)據(jù)使其變得更加全面。由于“樹序列”以一種高效的方式存儲(chǔ)數(shù)據(jù)，該數(shù)據(jù)集可以很容易地容納數(shù)百萬的額外基因組。
黃燕表示：“這項(xiàng)研究為下一代的DNA測序奠定了基礎(chǔ)。隨著現(xiàn)代和古代DNA樣本的基因組序列質(zhì)量的提高，這些‘樹’將變得更加精確，我們最終將能夠生成一個(gè)單一的、統(tǒng)一的地圖，解釋我們今天看到的所有人類遺傳變異的后裔?！?br>Wohns博士補(bǔ)充說：“雖然人類是這項(xiàng)研究的重點(diǎn)，但該方法對(duì)大多數(shù)生物都有效；從猩猩到細(xì)菌。它在醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)方面可能特別有益，可以將遺傳區(qū)域和疾病之間的真正聯(lián)系從我們共同的祖先歷史中產(chǎn)生的虛假聯(lián)系中分離出來?！?

(責(zé)任編輯：時(shí)尚)